Position is one of most important things. If you place your AD units in wrong place, you will loose clicks.
Here are few universal positions:

• Upper-left part of the website
• Above and under menu

Remember: most people will read your website from top-left to right-bottom!
Google gives us an very usefull information - before we even think about a good place for an advertisement, we should ask ourselvers these questions:

1. What is the user trying to accomplish by visiting my site?
2. What do they do when viewing a particular page?
3. Where is their attention likely to be focused?
4. How can I integrate ads into this area without getting in the users’ way?
5. How can I keep the page looking clean, uncluttered and inviting?

Don’t have Adsense yet?

Content length

If you have short article, you should place advertisement above the content:

Donec suscipit, quam pellentesque luctus rutrum, lacus odio vehicula quam, ac consequat risus orci sed urna. Duis id tellus. Vivamus auctor velit at velit. Suspendisse pharetra iaculis purus. Pellentesque id lacus non neque dictum convallis. Sed ut mi varius quam suscipit lobortis. Donec placerat consequat est. Aliquam vitae justo eu sapien pulvinar porta. Quisque suscipit commodo libero. Vivamus vitae nulla. Aliquam porttitor ipsum a pede. Praesent non tellus et sapien vulputate luctus. Pellentesque elementum, nisl vitae bibendum scelerisque, massa erat pretium urna, nec scelerisque nisi ipsum eu tellus. Mauris sit amet dolor eu leo venenatis gravida. Phasellus ut lorem. Ut ultrices tempor sapien. Nullam nonummy. Nam accumsan purus. Quisque ut est ut tortor bibendum consectetuer. In hac habitasse platea dictumst. Mauris nonummy enim ut turpis. Cras consequat quam ut arcu. Vestibulum ante ipsum primis in faucibus orci luctus et ultrices posuere cubilia Curae; Aliquam ipsum risus, ultrices non, rhoncus a, dictum id, nulla. Nulla id felis. Morbi ut orci. Etiam ac arcu quis arcu malesuada mollis. Phasellus vehicula. Pellentesque tellus urna, varius elementum, suscipit et, tincidunt at, dolor. Phasellus pede massa, consequat vitae, congue quis, auctor id, tellus.

If you have longer content, the reader will be tired after reading a part of it and will search for something else - that’s it - let’s serve him an advertisement (large rectangle works best in this case):

Donec suscipit, quam pellentesque luctus rutrum, lacus odio vehicula quam, ac consequat risus orci sed urna. Duis id tellus. Vivamus auctor velit at velit. Suspendisse pharetra iaculis purus. Pellentesque id lacus non neque dictum convallis. Sed ut mi varius quam suscipit lobortis. Donec placerat consequat est. Aliquam vitae justo eu sapien pulvinar porta. Quisque suscipit commodo libero. Vivamus vitae nulla. Aliquam porttitor ipsum a pede. Praesent non tellus et sapien vulputate luctus. Pellentesque elementum, nisl vitae bibendum scelerisque, massa erat pretium urna, nec scelerisque nisi ipsum eu tellus. Mauris sit amet dolor eu leo venenatis gravida. Phasellus ut lorem. Ut ultrices tempor sapien. Nullam nonummy. Nam accumsan purus. Quisque ut est ut tortor bibendum consectetuer. In hac habitasse platea dictumst. Mauris nonummy enim ut turpis. Cras consequat quam ut arcu. Vestibulum ante ipsum primis in faucibus orci luctus et ultrices posuere cubilia Curae; Aliquam ipsum risus, ultrices non, rhoncus a, dictum id, nulla. Nulla id felis. Morbi ut orci. Etiam ac arcu quis arcu malesuada mollis. Phasellus vehicula. Pellentesque tellus urna, varius elementum, suscipit et, tincidunt at, dolor. Phasellus pede massa, consequat vitae, congue quis, auctor id, tellus.

Nunc a ligula vel nisl tristique aliquet. Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Ut ut odio. Nulla massa neque, faucibus vel, tristique et, feugiat quis, quam. Donec tincidunt, pede non euismod scelerisque, sem ante vulputate lectus, et venenatis odio est ut ligula. Praesent at quam non nisi ultricies rutrum. Suspendisse ac sem vitae elit porta lobortis. Sed sed nunc eu tortor interdum vulputate. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et netus et malesuada fames ac turpis egestas. Etiam ac nunc vel sem consequat commodo. Aliquam pretium commodo nisl. Sed quam nulla, vulputate a, consectetuer ut, viverra a, elit. Pellentesque tincidunt, eros sed rutrum blandit, pede metus faucibus ipsum, mattis imperdiet mauris mauris sit amet erat. Fusce vehicula quam non sapien. Curabitur est lacus, egestas ut, ultricies gravida, elementum eget, felis. Praesent mi purus, vehicula et, blandit quis, adipiscing sit amet, lectus. Duis pulvinar porttitor pede. Nulla facilisi. Aenean fringilla lorem vitae massa. Vestibulum eget justo. Nam ornare est quis libero. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et netus et malesuada fames ac turpis egestas. Curabitur dignissim aliquet nisi. Vivamus nonummy elementum nisi. Fusce tortor mauris, tempor in, convallis vitae, interdum ac, leo. Phasellus mauris magna, rhoncus vel, convallis ut, volutpat ut, erat. Duis ac purus nec neque faucibus fringilla. Aenean suscipit risus ut nunc. Fusce consequat, dui ut imperdiet mollis, nisi purus consectetuer ligula, ac blandit lorem tortor sit amet nisl. Cras sollicitudin tortor a mauris. Sed ante leo, ornare nec, laoreet ac, tempor id, libero. Nam pellentesque interdum elit.